Nový cílový pracovní postup zaměřený na sekvenování kombinuje předem ověřený obsah s jednoduchým přizpůsobením a novými analytickými nástroji pro urychlení objevování variant a screeningu
ANN ARBOR, Michigan, 19. dubna 2018 /PRNewswire/ -- Společnost Swift Biosciences dnes oznámila zahájení komerčního prodeje svých rakovinových NGS panelů Accel-Amplicon Plus™ Cancer NGS Panels, sady devíti nádorově specifických a cílených genových panelů pro usnadnění cíleného sekvenování rakoviny. Technologie Accel-Amplicon umožňuje simultánní detekci jednotlivých variant nukleotidů, variabilitu počtu kopií a malou inzerci a deleci, aby se dosáhlo komplexního a exonového pokrytí hotspotových klinicky relevantních genů. Výzkumným pracovníkům také umožňuje spojit předem ověřený obsah a své vlastní cíle do rychlého jednočinného testu za účelem rozvoje informativních a škálovatelných pracovních postupů pro snazší dosažení vědeckých cílů.
Každý nádor nese jedinečnou kombinaci genomových změn, které mohou určovat rychlost růstu nádoru a reakci na léčbu. Cílené sekvenování pomocí zaměřených vícegenetických panelů poskytuje přesný a informativní způsob, jak rychle identifikovat klinicky akceptovatelné varianty v rámci známých nebo předpokládaných rakovinných genů. Nicméně vyvíjení panelů rakovinných genů vyžaduje znalost bioinformatiky k identifikaci genetických markerů a dodatečných zdrojů pro návrh, optimalizaci a validaci testu.
Accel-Amplicon Plus poskytuje modulární, mixovací a srovnávací schopnost, která poskytuje translačním laboratořím větší flexibilitu pro nasazení více než jedné strategie. Laboratoře mohou buď začít se širokou sadou genů, která je schopna komplexně profilovat nádory a pak upravovat obsah do nejvíce informativních markerů, nebo začít s velmi zaměřeným testem k běžnému screeningu známých a klinicky akceptovatelných variant. Každá analýza může být navržena tak, aby zpracovala až 1500 ampliconů na jeden panel. Analýzy byly navrženy a ověřeny odborníky společnosti Swift a jsou plně kompatibilní s degradovanými vzorky FFPE nebo vzorky zředěné tekuté biopsie.
„Rakovinové panely Accel-Amplicon Plus Cancer Panel mohou být převratem v oblasti rakoviny a onkologického výzkumu," řekl Haley Fiske, obchodní ředitel společnosti Swift Biosciences. „Integrováním předem ověřeného a přizpůsobitelného obsahu do jednoho panelu mohou kliničtí výzkumní pracovníci maximalizovat data získaná z každého vzorku nádorů a urychlit jejich snahu objevit a prozkoumat varianty rakoviny."
Rakovinové panely Accel-Amplicon Plus sestávají z devíti testů:
Panely pro nemoci
- Panel pro kolorektální tumory Accel-Amplicon Plus™
- Panel Lynchova syndromu Accel-Amplicon Plus™
- Panel rakoviny plic Accel-Amplicon Plus™
- Myeloidní panel Accel-Amplicon Plus™
Genové panely
- Panel profilování pankreatu 57G Accel-Amplicon Plus™
- Komplexní genový panel TP53 Accel-Amplicon Plus™
- Genové panely BRCA1 a BRCA2 Accel-Amplicon Plus™
- Genové panely BRCA1, BRCA2 a PALB 2 Accel-Amplicon Plus™
- Panel signální cesty EGFR Accel-Amplicon Plus™ EGFR
Hlavní funkce a výhody rakovinových NGS panelů Accel-Amplicon Plus zahrnují:
- Pokrytí tisíců klinicky relevantních mutací nalezených v databázích COSMIC a ClinVar, včetně těch, které jsou v hotspotových oblastech a na úrovni exonových nebo celogenových klíčových genů
- Detekci vzácných variant frekvence alel > 1 % k identifikaci zárodečných nebo somatických mutací ve stejném testu
- Poskytování robustního výkonu s přírůstkem vzorku o pouhých 10 nanogramů z degradovaných vzorků FFPE nebo omezených vzorků, jako je DNA bez buněk, jemné jehlicové biopsie nebo jiné malé biopsie
- Kompatibilitu se všemi sekvenátory Illumina
Díky velmi informativnímu obsahu, snadnému protokolu a spolehlivým výsledkům panely umožňují několik klíčových onkologických aplikací včetně:
- Sledování nebo potvrzení somatické varianty s nízkou frekvencí
- Profilování nádorů v čerstvých nebo konzervovaných vzorcích
- Screeningu pro náchylnost k nákazám, včasné odhalení a recidivu
- Terapeutické účinnosti a sledování
Současně s představením rakovinových panelů Accel-Amplicon Plus společnost zahájila nabídku otevřených a komerčních řešení pro urychlení analýzy velkých sad dat NGS s názvem Swift Bioinformatics Resources. První dva nástroje podporují cílený resekventní pracovní postup společnosti Swift, včetně nástroje Primerclip™, otevřeného zdrojového nástroje pro ořezávání základních prvků a pro FAST Analysis™, intuitivní software pro detekci variant od firmy Genialis, který dokonale integruje zarovnání, vyvolávání alel a souhrnné zprávy.
Rakovinové NGS panely Accel-Amplicon Plus jsou nyní komerčně dostupné. Více informací naleznete na webových stránkách www.swiftbiosci.com.
O společnosti Swift Biosciences
Společnost Swift Biosciences je poskytovatelem řešení pro přípravu knihoven pro sekvenování nové generace (NGS). Společnost, která sídlí v Ann Arbor ve státě Michigan, vyvíjí nová řešení pro přípravu knihoven pro nové aplikace založené na sekvenování příští generace, včetně sekvenování celého genomu, cíleného sekvenování DNA a epigenetické analýzy. Produkty společnosti Swift Biosciences jsou navrženy tak, aby zákazníkům pomáhaly analyzovat náročné biologické vzorky rychleji, jednodušeji a s větší citlivostí a přesností, přičemž jsou kompatibilní s předními přístroji. Společnost Swift Biosciences je první společností, která nabízí řešení pro přípravu knihoven na všech třech hlavních platformách pro zpracování sekvencí, včetně technologií Pacific Biosciences®, Illumina® a Ion Torrent™.
Společnost zahájila svou činnost v únoru 2010 a její vývoj produktů umožňuje nové aplikace v mnoha průmyslových odvětvích, včetně agrogenomiky, a v oblasti farmaceutického, akademického, biotechnologického a onkologického výzkumu.
Více informací naleznete na webových stránkách SwiftBioSci.com; společnost Swift Biosciences můžete sledovat na Twitteru (@SwiftBioSci).
SOURCE Swift Biosciences